Лаборатория стабильности генома

Заведующий лабораторией

Кантидзе Омар Леванович
доктор биологических наук
заместитель директора по научной работе,
заведующий лабораторией Стабильности генома

Научные интересы:

хроматин, эпигенетика, репарация ДНК,

репликация ДНК, ядерная организация

Общая информация

На протяжении последних лет наши исследовательские интересы включают две основные области – клеточный ответ на повреждение ДНК (DDR – DNA damage response) и пространственную организацию генома (3D-геном). Исследования лаборатории направлены на характеристику путей и компонентов DDR, которые активируются в ответ на различные клеточные стрессы. В настоящее время нашей основной задачей является изучение новых путей DDR, действующих в ядрышке и предотвращающих нестабильность рибосомной ДНК. С точки зрения 3D-генома, нам интересно выяснить роль так называемых слабых биологических сил (в частности, феномена разделения фаз в жидкости) в установлении и поддержании пространственной организации генома эукариотической клетки. Отдельной задачей является поиск и характеристика новых эпигенетических препаратов, способных модулировать экспрессию генов, воздействуя на 3D-геном. В работе мы используем как традиционные методы молекулярной и клеточной биологии, так и передовые технологии, такие как микроскопия сверхвысокого разрешения (SIM, STORM, STED) и полногеномные исследования (Hi-C, ChIPseq, RNAseq и т. Д. ) и анализ данных.

Сотрудники

Избранные публикации

2021 – Treacle and TOPBP1 control replication stress response in the nucleolus 

Velichko AK, Ovsyannikova N, Petrova NV, Luzhin AV, Vorobjeva M, Gavrikov AS, Mishin AS, Kireev II, Razin SV, Kantidze OL.

J Cell Biology 220 (8), e202008085. doi: 10.1083/jcb.202008085

 

2021 – Suppression of liquid-liquid phase separation by 1,6-hexanediol partially compromises the 3D genome organization in living cells. 

Ulianov S.V., Velichko A.K., Magnitov M.D., Luzhin A.V., Golov A.K., Ovsyannikova N., Kireev I.I., Gavrikov A.S., Mishin A.S., Garaev A.K., Tyakht A.V., Gavrilov A.A., Kantidze O.L.*, Razin S.V.*

Nucleic Acids Res. 2021 Apr 9. doi: 10.1093/nar/gkab249.

 

2021 – LASCA: loop and significant contact annotation pipeline. 

Luzhin A.V., Golov A.K., Gavrilov A.A., Velichko A.K., Ulianov S.V., Razin S.V. Kantidze O.L.

Scientific Reports 11, 6361

 

2020 – The 3D genome as a target for anticancer therapy. 

Kantidze O.L., Gurova K.V., Studitsky V.M., Razin S.V.

Trends in Molecular Medicine, 26 (2), 141-149

 

2020 – Weak interactions in higher-order chromatin organization. 

Kantidze O.L., Razin S.V.

Nucleic Acids Res, 48 (9), 4314-4626

 

2019 – Hypoosmotic stress induces R loop formation in nucleoli and ATR/ATM-dependent silencing of nucleolar transcription. 

Velichko A.K., Petrova Nad.V., Luzhin A.V., Ovsyannikova N., Strelkova O.S., Kireev I.I., Petrova Nat.V., Razin S.V., Kantidze O.L.

Nucleic Acids Res, 47 (13), 6811-6825

 

2019 – The anti-cancer drugs curaxins target spatial genome organization. 

Kantidze O.L., Luzhin A.V., Nizovtseva E.V., Safina A., Valieva M.E., Golov A.K., Velichko A.K., Lyubitelev A.V., Feofanov A.V., Gurova K.V., Studitsky V.M., Razin S.V.

Nature Commun, 10 (1), 1441

 

2018 – Synthetically lethal interactions of ATM, ATR, and DNA-PKcs. 

Kantidze O.L., Velichko A.K., Luzhin A.V., Petrova N.V., Razin S.V.

Trends in Cancer, 4 (11), 755-768

 

2016 – Small molecule compounds that induce cellular senescence. 

Petrova N.V., Velichko A.K., Razin S.V., Kantidze O.L.

Aging Cell, 15 (6), 999-1017

 

2015 – Mechanism of heat stress-induced cellular senescence elucidates the exclusive vulnerability of early S-phase cells to mild genotoxic stress. 

Velichko A.K., Petrova N.V., Razin S.V., Kantidze O.L.

Nucleic Acids Research, 43 (13), 6309-6320

 

All papers in 

Текущие гранты

Фонд

Название

РНФ

Механизмы поддержания стабильности 3D-генома и технологии его направленного изменения для решения фундаментальных и прикладных задач

РФФИ

Механизмы индуцируемой гипертермией сенсибилизации клеток к ингибиторам ферментов репарации ДНК