В докладе будут рассказаны три истории, связанные общим эволюционным подходом к геномным и транскриптомным данным.
1. Редактирование мРНК у головоногих моллюсков: мы видим следы положительного отбора, что должно указывать на функцию, но не понимаем, в чем она [Moldovan et al.: PeerJ 2020, doi 10.7717/peerj.10456; Sci. Rep. 2022, doi 10.1038/s41598-022-07460-5].
2. Обязательные сдвиги рамки и четверные кодоны у ресничных инфузорий Euplotes: думали, что это функционально, а эволюционирует под почти нейтральным отбором [Gaydukova et al.: PNAS 2023, doi 10.1073/pnas.2221683120].
3. Судя по транскриптому, программа развития куколок насекомых с полным превращением частично повторяет программу развития эмбриона [Ozerova et al.: Sci. Rep. 2022, doi 10.1038/s41598-022-22188-y; bioRxiv 2024, doi 10.1101/2024.06.17.599350].