Одним из самых актуальных направлений в молекулярной генетике является изучение взаимосвязи между архитектурой генома и его функционированием. Образование независимых транскрипционных доменов и пространственные контакты между регуляторными участками отдельных локусов или хромосомами зависят от архитектурных белков. Мы изучаем механизмы, с помощью которых архитектурный белок дрозофилы Su(Hw) формирует комплексы, обладающие разной регуляторной активностью, специфично связывающиеся с геномными сайтами и обеспечивающие дистанционные взаимодействия между энхансерами и промоторами.
Su(Hw)-зависимый белковый комплекс является уникальной моделью для исследования, так как уже известны основные белки, входящие в его состав и влияющие на его активность - Su(Hw), Mod(mdg4)-67.2 и CP190. Известно, что белок Mod(mdg4)-67.2 специфично взаимодействует только с белком Su(Hw). Однако локус mod(mdg4) кодирует более 30 изоформ белка, которые имеют различные С-концевые домены. Роль прочих изоформ Mod(mdg4) в регуляции транскрипции и в организации структуры хроматина остается практически не исследованной. Мы предполагаем, что изоформы белка Mod(mdg4) способствуют сайт-специфичному связыванию белковых комплексов, регулирующих транскрипцию. Поэтому мы изучаем механизм взаимодействия между различными изоформами Mod(mdg4) и ДНК-связывающими белками.
В работе мы сочетаем методы классической генетики (скрещивание мутантов дрозофилы с последующим генетическим и фенотипическим анализом потомства) с современными методами молекулярной биологии (CRISPR/Cas9 редактирование генома, qChIP-анализ, RT-PCR, GST Pull Down и.т.д.).